在杨继盛下定决心以死谏之时，他也想到了自己之前在兵部任职时认识的同事王遴（字继津）：“仰读手教，足见兄以天下为已任，敬羡敬羡。宣、大系天下安危，弟岂不知？使弟在部，必为兄之所为者。乃阻抑若此者何？盖以兄处最嫌疑之故耳。况老贼报复害人之巧，入于至神者乎。此弟之所甚虑，而知已溺爱迫切之情，如何能已！此事在他人为之如何？不可。而在兄为之，则甚不可。兄才尚有大展时节，此时且敛锋蓄锐。俟时可为，则轰烈一场，勿徒惟尽其心而不计事之成否。人皆知致身为忠，不知为天下爱其身尤为忠之大者。请兄更思之。——九月廿六日弟继盛拜继津兄赐谒。”
胡子睿看到“老贼报复害人之巧，入于至神者乎”，不得不感叹杨继盛对严嵩了解至为深刻。
在杨继盛心中，还有多年前就认识的好友唐顺之，他专程感到镇江就是要见唐顺之最后一面：“杨子怀人渡扬子，椒山无意会焦山。地灵人杰天然巧，瞬息神游万古间。——杨继盛书。时嘉靖壬子冬，约会唐荆川到此。”
胡子睿知道唐荆川就是唐顺之，唐顺之是位全才，对于军事、文学、音律等都有很深的造诣；胡子睿前世曾经去焦山碑林游玩，焦山碑林建于北宋庆历八年（公元一千四百零八年），当时为宝墨亭。后来规模逐渐扩大，杨继盛手书的“椒山横额”等若干若干手迹碑文，专门放置于“仰止轩”以共瞻仰。
杨继盛的直言进谏惹怒了嘉靖皇帝，将他革职查办，严嵩、严世蕃父子也恨杨继盛入骨，在嘉靖皇帝面前指着或问二王字样，说杨继盛无端将裕王朱载垕、景王朱载圳（俱为嘉靖皇帝亲子，裕王即来继位的隆庆皇帝）牵连进来，是挑拔嘉靖皇帝与裕王朱载垕、景王朱载圳的父子之情，杨继盛直言道：“满朝文武中除了裕王朱载垕、景王朱载圳之外，谁不怕严嵩呢?“嘉靖皇帝“勃然大怒”下，下令廷杖一百（前文曾经在文震孟的相关章节中，曾经描写过廷杖之惨烈，这里不再复述，感兴趣的朋友可以去看看）。
廷杖一百，简直是足以把人打死的刑罚；杨继盛上书揭露严嵩、严世蕃父子”倒行逆施“之举，得到不少朝野人士的同情；在执行廷杖之前，杨继盛的朋友王西石买通狱卒，送给杨继盛一付蚺蛇胆（蟒蛇的胆），让他服用以止痛，杨继盛笑了笑，纳入袖中；一位与杨继盛素未谋面的锦衣卫，送给他酒一壶，让杨继盛以酒服用蚺蛇胆，这样打起来就不是那么痛了。
杨继盛慷然曰：”笑话，天下岂有怕打的杨椒山者，椒山自有胆，何必蚺蛇哉!“杨继盛毕意也是血肉之躯，一百仗打完，已经被打得“两腿肿粗，相摩若一，不能前后;肿硬若木，不能屈伸。止手扶两人，用力努挣，足不覆地而行入狱。“杨继盛之所以能逃过被当场打死的噩运，也有陆炳授意放水的缘故，当时朝野有很多人为他送药，都被严嵩的党羽中途拦截，为了害死杨继盛，严嵩的党羽更将他转到条件更差的监狱。
杨继盛痛晕了过去，他做了一个梦，他仿佛回到了八岁的时侯，他在牧牛的时侯，或宿于场园，或宿于瓜铺，当时他和家人不知，就算不见他人，亦不怎么寻找他。当时有位老儒，姓沈名琇不知字号，在村中设发蒙教。
他偷偷前往观看沈琇教学，见诸生揖容之美，闻诸生吟诵之声，心里颇为向往；于是他告诉兄长：“我欲入学读书！”，兄长说：“尔年幼。”欲拒绝他。他曰：“年幼能牧牛，乃不能读书耶？”又告诉父亲，终于入学从师矣。凡沈琇所教书四五遍即能成诵，从学四五日后即能对句。当时有年长而来学习的学生，师父出对联云：“老学生。”众人“面面相觑”不能对。于是师父问道他，他应声云：“小进士。”师父喜出望外云：“此儿将来必‘金榜题名’矣。”
他十九岁时，娶胡村张公讳杲次女为妻。当时，乡人见他在学问上颇有上进，富人们多许妻以女。他曰：“富室之幼女，岂可处于兄嫂之间耶？”张杲是兄长之叔丈也，家以耕织为业，家里没有什么钱，其行谊为乡里所重。又闻其女，为人颇为贤良，他喜爱张杲女与嫂子既为姊妹，妯娌之间必定和眭，于是娶了她。
他自操井灶之劳，秫杆五根剖开可以熟饭。冬天的时侯，常常自已汲水，手与筒经常冻住，需要呵口气方能化开，开始做饭的时侯，常常缺油，每次因为点不起蜡烛，只能在月光下读书。夜里寒气上升，腿肚常常挨冻，起来绕着房间疾走，身上才有点热量，吃的苦难于用言语表达，妻子跟着他也受了不少困苦。
他三十四岁时，拜南京兵部尚书韩邦奇为师学音律，学了三月尽得他的技术矣，乃告于师曰：“乐学非他学比，不可徒事口说，必自善制器，自善作乐，播之声音，各相和谐，然后为是。”于是他自置斧、锯、刀、钻，构桐竹，易丝漆。先自制其管，管和矣，制其琴；琴和矣，制其瑟；瑟和矣，制其箫、笙、埙、箎之类，无不各和矣。又合诸乐总奏之，如出一律，无不和焉。师甚喜，曰：“我学五十年，止得其数。今赖子制其器，和其音，当代之乐，舍子其谁欤？”
有一天师父跟他谈曰：“吾欲汝制十二律之管，每管各备五音七声，各成一调，何如？”他有难色。师曰：“固知此是难事，古之伶伦无所因而作乐，况今有度数可考乎？子之资性甚高，试精思之，必可能矣。”他苦心思索，“废寝忘食”整整三日。忽然在梦中见到大舜坐于堂上，他连忙上前参拜。案上设金钟一，舜于是跟他曰：“此黄钟也，子可击之。”他取椎连击三。醒来“恍然大悟”，连忙叫来妻子点灯，取竹与锯钻，制成十二音律。呈于师，师喜曰：“刻志乐之日，九鹤飞舞于庭，其应乃在子乎？”