明洪武元年（1368年）征服广西后，鉴于当地复杂的民族分布，明太祖采用不同的统治制服，在广西中东部汉夷杂居地区设立州县，西部偏远地区由土司管理，有一部分居住在山野的瑶人和壮人，不当差，不纳粮，也没有户籍，不与明朝政府联系，过着几乎原始的生活，缺乏生活物资，经常四处劫掠，明朝政府称之为“瑶变”
明中叶以来，广西土司不断向西扩张势力范围，瑶民的生存空间缩小，社会矛盾不断激化，自永乐十三年以来，“瑶变”越演越烈，1447年，正统七年，候大狗，和蓝受贰发动大规模叛乱，明朝政府随即镇压，经过三年游击战争，没能镇压下去，1450年，英宗皇帝土木堡被俘，明廷无暇顾及瑶变。
面对岭南的严重叛乱，明朝从景泰三年（1452年）到天顺六年（1462年）曾发起数次征讨，但收效不大。侯大狗的游击战术让明朝官军头痛不已。“我出此贼往彼，我往彼则出此，（贼）巧相回避，（官军）迄难成功。”在这种情况下，明朝两广守将皆自顾不暇，只能龟缩城中，不敢出城对阵。
成化元年（正月），紫禁城乾清宫，朱见深正在看大明南疆地图，“怀恩，平叛大军到两广了没，”“回皇上，应该快到了，韩大人带兵平叛，您就放心吧！”“嗯，也是，那朕就等他的好消息了”
成化元年（1465年）正月，朱见深调集来自北京、南京、南直隶（江苏安徽）、江西、湖广、广西六省的军队，包括汉军步兵、蒙古骑兵、以及广西土司所辖强悍善战的狼兵组成的16万大军，展开了对岭南空前规模的军事征讨。朱见深任命都督同知赵辅为征蛮将军，都督和勇（蒙古人）为游击将军，充任前线正副总指挥。提升浙江左参政的韩雍为都察院左佥都御史，赞理军务。
朱见深特别嘱咐：“阃外之事，一以属雍”，韩雍由此成为此次行动的最高统帅。六月，韩雍抵达南京，与诸将商讨作战方略。
韩雍认为叛乱势力已经蔓延数千里，如果分兵广东，势必会陷入游击战的泥潭而疲于奔命。应该集中兵力直捣大藤峡，攻其腹心之地，倾覆巢穴，其余则可迎刃而解。作为明朝少有的文武全才，韩雍断然采取了反游击战中的原则，直捣中坚，击其流散，显示了过人的魄力和战略眼光。诸将闻言大为赞赏，都督赵辅也信服韩雍的军事才能。
于是明军最终确定了这个作战计划，韩雍督率3万先头部队南下，于当年八月开进广西，经全州直达桂林。他在中途击破一些叛乱的苗人，抵达桂林后又将4个失职将领斩首示众，恩威并施，明军军心大振。
韩雍仔细分析了瑶民的势力范围和地理位置，敏锐判断出侯大狗以荔浦、修仁两县为两翼掩护其核心根据地。
于是明军采用了反游击战中第三条原则，兵分5路进攻荔浦、修仁，以孤立大藤峡。官军以强大兵力首先将修仁的叛军主力击溃，杀7300多人，生擒1200多人。随后，荔浦也被攻破。大藤峡以北门户洞开，韩雍率军到达大藤峡南面的桂平，开始部署围剿。
大藤峡为喀斯特地貌，地形复杂，易守难攻。韩雍一时难有良策，便向当地官绅征求意见。大多数官绅认为，大藤峡瑶民虽已蔓延数百里，但附近地区山势险要，交通不便，只要派兵将大藤峡包围，封锁交通要道，切断瑶民之间的联系，就会不攻自破。
对此，韩雍不以为然，他认为兵贵神速，大藤峡周边绵延600多里，官军纵然再多，也难以完全封锁。这样消耗下去，不仅徒增军费开支，也会挫伤军队士气，不利于作战。
他说：“兵法曰：‘宁我薄人。’又曰：‘先人有夺人之心。’今我军新破府江，勇气百倍，贼闻震恐丧魄矣，因而弃之，可立破也。”于是明军全速进军大藤峡，直捣叛军大本营。为了尽快解决叛逆。
韩雍将他的16万大军分为左右两个兵团：右翼兵团68000人，自象州、武宣南下，分五路进攻大藤峡之北；左翼兵团92000人，由桂平、平南分八路进攻大藤峡之南。