这让他们对蔓延的疟疾无法控制，疟疾不一定杀死每个人，但至少有三成以上的死亡率，比战死的比例还高；而且感染疟疾之后，战斗力会丧失，发烧虚弱等症状，会让人感到绝望，别提进攻了，此时能保住軍队不哗变都很困难。
关键还是恐慌，这种让人无助疾病在中西方古代文学作品中都十分常见，西方人直接将其称作魔鬼；魏晋南北朝时期，赫赫有名的建安七子，在疟疾爆发的瘟疫中，五人死于同一年，这种大文人的生活条件和健康状况都无法抵御疟疾，更不用说战场上苦战了一年，居住条件恶劣，健康状况不良的軍队了。
中国軍队始终以守为主，攻防结合，不断的从英俄联军的薄弱处进行突击，两军的战斗状态始终持续，因此敌人渐渐停止的攻势，很快就被中国軍队注意到，而且查明了原因，通过俘虏知道敌人染上了瘴气。
疟疾在中医中被成为瘴气，认为是吸入了毒气所致。在西方也被认为是吸入了沼泽地区的毒气所致，因为常发生在潮湿的沼泽地带。
敌人的不利情况迅速反馈到了最高层，此时内阁产生了不同看法，文官为主的官员，建议此时可以停止大规模攻势，跟敌人脱离接触，让敌人在瘟疫的打击下自行崩溃，他们说这叫坐敌自败。
文官的理由是，跟敌人大规模接触，有可能让本国軍队也感染上瘟疫。事实上，还是出于文官的仁道思想，他们对死亡天生排斥。
但軍队不这么认为，讥笑这种坐敌自败的思想十分危险，他们坚持应该继续出击，攻守结合才是正确战术，任何死守的思想都可能引起失败。
军官的理由是，在敌人行将崩溃的时候，给他们施加更大的压力，压断他们紧绷的脊梁，彻底击败敌人。
周琅支持了軍队的意见。
大规模的反攻开始了。
在长达数百公里的哈萨克丘陵防线上，中国軍队开始更频繁的出击，通过数以千计的各种大小隘口，他们向丘陵外的敌人阵地发动进攻，英俄联军困于疟疾，战斗力越来越弱，关键是战斗意志大幅度下降。
胜利的消息不断传回国内，虽然没有什么决定性胜利，最大的歼敌俘敌数量也很少超过万人。
但接连的小规模失败，让英俄联军决定后撤，他们计划先退到图尔盖高原一带，依托高原地形和图尔盖河、伊希姆河防御，这样更靠近俄国国土，交通运输可以得到改善，生病士兵可以退到后方治疗。等待軍队恢复战斗力之后，再跟中国进行决战，今年取得决定性胜利的机会，现在看来已经很渺茫了。根据西方人的经验，这种疟疾往往会在秋天天气转凉之后，自行消散。
可惜他们的对手不肯给他们从容后撤的机会，开始发动了全线进攻，这让英俄联军头痛不已，在敌人强攻的情况下，强行撤回肯定会引起崩溃，不撤退的话，疟疾越来越严重的削弱了联军的战斗力，士气普遍低落，以这样的軍队对抗中国人，风险也很大。
在这种不利时机下，英俄两国决定采取其他方法，唯一可行的就是政治方法，他们通过中立国向中国传达和谈的要求。
中国表示可以谈判，但要求在哈萨克的英俄联军全部投降，这等于拒绝谈判，因为将两百多万軍队交给中国，等于将俄国的命运交给中国了。
战斗只能在这种情况下继续进行。